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CAMPAGNE 2008 - DEMANDE D'HABILITATION

Paris5 / SHS / L2. EXAMEN TSO3. SESSION, 2008 ... BARÊME DE L'EXAMEN FINAL. Question analytique : - introduction (enjeu, reformulation de la question, ...




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Intitulé de l'UE   Compléments de MicrobiologieMention de MasterSpécialités intégrant l'UEMicrobiologie, biologie végétale et biotechnologiesM2, Spécialité « Enseignement et Formation en Biotechnologies »Semestre n°Semestre 3Crédits3Acquis conseillésNotions de microbiologieContenusDifférentes parties viennent compléter les notions acquises dans les différentes UE de microbiologie : 1/Les champignons filamenteux : classifications, architecture des cellules fongiques, cycles de développement (sexué, asexué, parasexué), croissance, sporulation, systèmes d’incompatibilités (mating type), génétique (recombinaison et cartographie génétique, hétérocaryose, cycle de reproduction parasexué et recombinaison mitotique), expression de protéines hétérologues chez les champignons filamenteux, valorisation alimentaire et non-alimentaire de la matière première agricole par les champignons filamenteux.
2/Fermentations industrielles ; production industrielle de biomasse
3/ Agents antimicrobiens :
-Agents physiques. Applications à la stérilisation et à la stabilisation de produits d’origine biologique ou à utilisation biologique.
-Agents chimiques. Désinfectants et antiseptiques ;antibiotiques (structure, classification, mode d’action, utilisation thérapeutiques ;résistance aux antibiotiques.ResponsablesSandrine PagèsEnseignants intervenant dans l'UESandrine Pagès, MCU U1
Jean-Jacques Allais, MCU U1
Annick Chastin, PR du secondaire à la retraiteModalités de contrôle des connaissancesExamen écrit terminalHeures étudiant (présentiel)CMTDTPStageH-Et20H-Et10H-Et0H-Et0
Intitulé de l'UE   MétabolismesMention de MasterSpécialités intégrant l'UEMicrobiologie, biologie végétale et biotechnologiesParcours « Enseignement et Formation en Biotechnologies »Semestre n°Semestre 3Crédits3Acquis conseillésEnzymologie, Biochimie Structurale, MicrobiologieContenusLes cours traiteront du Métabolisme sur la base des programmes des BTS Biotechnologies, Analyses de Biologie Médicales, Bioanalyses et contrôles. Certains aspects de biochimie structurale et d’applications biotechnologiques seront vus.
Production d'énergie : le catabolisme :
La glycolyse et la glycogénolyse
Devenir du pyruvate en anaérobiose. Fermentations lactique et éthanolique
Devenir du pyruvate en aérobiose : décarboxylation oxydative
Le cycle de Krebs
Le catabolisme des acides gras saturés et la lipolyse
Genèse et utilisation des composés cétoniques
Mise en réserve de l'énergie :
Glucogénèse et néoglucogénèse
Glycogénogénèse Lipogénèse
Régulations métaboliques
Métabolismes microbiens :
Métabolisme énergétique (types respiratoires)
Métabolisme glucidique (applications à l'identification des bactéries et des champignons)
Métabolisme protidique (applications à l'identification des bactéries)
Photosynthèse bactérienne.
Régulation du métabolisme microbien.
Rôle des micro-organismes dans les grands cycles de transformation de la matière dans la biosphère.ResponsablesMathieu NouaillerEnseignants intervenant dans l'UEMatthieu Nouailler, MCU Université d'Aix-Marseille I
Annick Chastin, PR de l’enseignement secondaire retraitée Modalités de contrôle des connaissancesExamen écrit final Heures étudiant (présentiel)CMTDTPStageH-Et21H-Et9H-Et0H-Et0
Intitulé de l'UE   Recherche bibliographique en biotechnologies, situations d’enseignementMention de MasterSpécialités intégrant l'UEMicrobiologie, biologie végétale et biotechnologiesM2, Spécialité « Enseignement et Formation en Biotechnologies »Semestre n°Semestre 3Crédits3Acquis conseillésCulture scientifique approfondie en microbiologie, biochimie, biologie cellulaire et biologie humaine. Expérience d’un stage dans une entreprise ou un laboratoire du secteur.ContenusProjet tutoré : étude technique et bibliographique sur un thème choisi par l’étudiant en lien avec le stage effectué entre les 2 années de préparation.
Domaine disciplinaire : biotechnologies (biologie cellulaire, biochimie, biologie moléculaire, microbiologie ou biologie humaine).
Domaine pédagogique : l’aspect technique doit être transposé à un niveau correspondant aux programmes des lycées ou des sections de techniciens supérieurs.
Restitution écrite communiquée au tuteur ainsi qu’à un responsable du master du domaine choisi par le candidat (avec les notions-clés des connaissances, éventuellement les aspects épistémologiques et expérimentaux).
Restitution orale en présence d’un jury composé d’un enseignant du secondaire et d’un enseignant universitaire. Au cours de cet exposé, il utilisera les moyens courant de présentation (vidéoprojecteur, informatique associée, etc.)
Le rapport ainsi que l’exposé permettront d’apprécier l’authenticité et l’actualité du problème choisi par l’étudiant, sa capacité à en faire une présentation construite et claire, à mettre en évidence les questionnements qu’il suscite et à dégager les points remarquables et caractéristiques de la discipline. Ils permettent également à l’étudiant de mettre en valeur la qualité de son dossier et l’exploitation pédagogique pertinente qu’il peut en faire dans le cadre d’un enseignement.ResponsablesMathieu NouaillerEnseignants intervenant dans l'UETuteurs de dossier (correspondants aux Professeur Conseiller Pédagogique du stage de S4 pour chaque étudiant).
Mathieu Nouailler, MCU U1
Annick Chastin, professeur du secondaire retraitéeModalités de contrôle des connaissancesContrôle continu : 0%, Contrôle terminal : 100%
Dossier
Epreuve oraleHeures étudiant (présentiel)CMTDTPStageH-Et0H-Et60H-Et0H-Et0
Intitulé de l'UE   Réinvestissement des connaissances disciplinaires en biotechnologie 1Mention de MasterSpécialités intégrant l'UEMicrobiologie, biologie végétale et biotechnologiesM2, Spécialité « Enseignement et Formation en Biotechnologies »Semestre n°Semestre 3Crédits6Acquis conseillésConnaissances approfondies en biotechnologiesContenusTravail de mobilisation et d’organisation des connaissances scientifiques afin de rédiger un devoir de synthèse sur un thème transversal des biotechnologies. Préparation à la première épreuve écrite du concours : l’épreuve de synthèse.
Dans une séance introductive, l’exercice demandé sera expliqué en détail. Puis des devoirs sur table seront organisés (4 au total) ; ils seront corrigés par 2 ou 3 correcteurs. Pour chaque devoir, après correction et rendu des copies, une séance de TD de 2 heures sera consacrée à sa correction. ResponsablesMathieu NouaillerEnseignants intervenant dans l'UEAnne Mauffrey, PRAG U1
Matthieu Nouailler, MCU U1
Chantal Tardif, PU U1Modalités de contrôle des connaissances4 épreuves écrites de 5h (situation du concours)Heures étudiant (présentiel)CMTDTPStageH-Et0H-Et60H-Et0H-Et0
Intitulé de l'UE   Réinvestissement des connaissances disciplinaires en biotechnologies 2Mention de MasterSpécialités intégrant l'UEMicrobiologie, biologie végétale et biotechnologiesM2, Spécialité « Enseignement et Formation en Biotechnologies »Semestre n°Semestre 3Crédits6Acquis conseillésConnaissances approfondies en biotechnologiesContenusTravail d’analyse de documents divers en français ou en anglais (expériences, protocoles, procédés,….). Préparation à la 2ème épreuve écrite du concours : Etude d’un système, d’un procédé ou d’une organisation.
Dans une séance introductive, l’exercice demandé sera expliqué en détail. Puis des devoirs sur table seront organisés (4 au total) ; ils seront corrigés par 2 ou 3 correcteurs. Pour chaque devoir, après correction et rendu des copies, une séance de TD de 2 heures sera consacrée à sa correction. ResponsablesMathieu NouaillerEnseignants intervenant dans l'UEAnne Mauffrey, PRAG U1
Matthieu Nouailler, MCU U1
Sandrine Pagès, MCU U1Modalités de contrôle des connaissances4 épreuves écrites de 5h (situation du concours)Heures étudiant (présentiel)CMTDTPStageH-Et0H-Et60H-Et0H-Et0
Intitulé de l'UE   Travaux Pratiques 3Mention de MasterSpécialités intégrant l'UEMicrobiologie, biologie végétale et biotechnologiesSpécialité « Enseignement et Formation en Biotechnologies »Semestre n°Semestre 3Crédits3Acquis conseillésM1 MBVB, parcours « enseignement et formation en biotechnologiesContenusTP de biologie cellulaire et hématologieResponsablesMathieu NouaillerEnseignants intervenant dans l'UEProfesseurs du lycée Marie Curie :
Christine Montixi, Karine Baud, Aurélie Aniorte Modalités de contrôle des connaissancesExamen terminal pluridisciplinaire de travaux pratiquesHeures étudiant (présentiel)CMTDTPStageH-Et0H-Et0H-Et30H-Et0Nb-Gpe0Nb-Gpe0Nb-Gpe1Nb-Gpe0Eff/Gpe0Eff/Gpe0Eff/Gpe14Eff/Gpe0
Intitulé de l'UE   VirologieMention de MasterSpécialités intégrant l'UEMicrobiologie, biologie végétale et biotechnologiesTous les parcours de M1 + Spécialité « Enseignement et Formation en Biotechnologies »Semestre n°Semestre 3Crédits3Acquis conseillésNotions de biologie de licence et de M1ContenusClassification des virus. Cycle viral. Exemples de virus (plantes et animaux)
Cet enseignement a pour but d'apporter les bases nécessaires à la compréhension des mécanismes d'interaction entre les virus et la cellule. Il traite notamment des stratégies d'expression du génome viral et des facteurs viraux et cellulaires impliqués dans le tropisme viral. Dans ce contexte, la relation entre la structure des protéines virales et leurs fonctions est exposée. L’enseignement expose les aspects d’évolution virale, de quasi espèces et de l’épidémiologie virale. Font également partie de cet enseignement, certains aspects de virologie appliquée, comme l'étude des vecteurs viraux en tant qu'outils en thérapie génique, des notions de pathogenèse et de protection antivirale (résistances naturelles, immunité innée et acquise, vaccination et traitement chimique). La composition de cet enseignement constitue une introduction aux étudiants souhaitant soit poursuivre leurs études en virologie spécialisée, et notamment en rétrovirologie soit se familiariser avec les techniques de virologie appliquée utilisées dans la recherche et en biotechnologie.
Un chapitre est consacré aux bactériophages.ResponsablesChristophe RobagliaEnseignants intervenant dans l'UEChristophe Robaglia, PU Université d’Aix-Marseille 2
Mireille Ansaldi, CR CNRS
Modalités de contrôle des connaissancesExamen écrit finalHeures étudiant (présentiel)CMTDTPStageH-Et24H-Et6H-Et0H-Et0










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