Td corrigé TS10 Acides amines RMN pdf

TS10 Acides amines RMN

Document réalisé par un collectif de professeurs de biochimie génie biologique de ..... TD : expérience de diffusion du glucose à travers un fragment d'intestin + ...




part of the document



FICHE 1
Fiche à destination des enseignants

TS 10
Spectroscopie RMN

Type d'activitéExercice bilanNotions et contenus du programme de Terminale S

Spectres RMN du proton
Identification des molécules organiques à l’aide :
du déplacement chimique
de l’intégration
de la multiplicité du signal : règles des (n+1)-uplets
Théorie de Brönsted : acides faibles, bases faibles ; domaines de prédominance (cas des acides carboxyliques, des amines, des acides ±-aminés).
Compétences exigibles du programme de Terminale S

Relier un spectre RMN simple à une molécule organique donnée, à l aide de tables de données ou de logiciels.
Identifier les protons équivalents. Relier la multiplicité du signal au nombre de voisins.
Connaître les règles de nomenclature des squelettes carbonés.


Identifier l’espèce prédominante d’un couple acide- base connaissant le pH du milieu et le pKa du couple.Commentaires sur l’exercice proposéIl s’agit d’une proposition d’exercice de type tâche complexe : à l’aide de ses connaissances, l’élève est invité à mettre au point une méthode pour attribuer les spectres aux espèces.

Cette activité illustre le thème
« OBSERVER »
Analyse spectrale
et le sous thème
Spectres RMN du proton
en classe de terminale S.Conditions de mise en œuvre Cette évaluation peut se situer en fin de chapitre.Pré requisReprésentation des molécules organiques (programme de 1ère S)
Fonctions chimiques
RemarquesLes spectres RMN sont disponibles sur
 HYPERLINK "http://riodb01.ibase.aist.go.jp/sdbs/cgi-bin/direct_frame_top.cgi"http://riodb01.ibase.aist.go.jp/sdbs/cgi-bin/direct_frame_top.cgi
ou  HYPERLINK "http://www.nmrdb.org/predictor"http://www.nmrdb.org/predictor
Fiche 2
Enoncé à destination des élèves

TS 10
Spectroscopie RMN

Vous êtes technicien de laboratoire au sein d’une équipe de recherche : votre rôle est de réaliser et d’interpréter des analyses pour aider les chercheurs à avancer dans leurs recherches. La spectroscopie RMN est un des outils privilégiés pour l’analyse des molécules. On peut par exemple utiliser la RMN pour identifier un produit inconnu.


Document 1 : Protocole pour la réalisation d’un spectre RMN

Diluer le réactif dans un solvant deutéré (CDCl3, DMSO-d6, D2O) (quelques mg de produit dans 1mL de solvant) dans un tube à essai.
Placer la solution dans un tube RMN.
Placer le tube dans la machine.
Acquérir le spectre.


Document 2 : Matériel pour la réalisation de spectres RMN














a. Spectromètre RMN b. Tube pour placer l’échantillon


( HYPERLINK "http://www.icmcb.u-bordeaux.fr/services/rmn.html"http://www.icmcb.u-bordeaux.fr/services/rmn.html) ( HYPERLINK "http://www.icmpe.cnrs.fr/spip.php?article238"http://www.icmpe.cnrs.fr/spip.php?article238)

Document 3 : Acides aminés et protéines (d’après Wikipédia)

Les acides aminés (ou aminoacides) sont une classe de composés chimiques possédant deux groupes fonctionnels : à la fois un groupe carboxyle –COOH et un groupe amine –NH2. Parmi ceux-ci, les acides ±-aminés se définissent par le fait que leur groupe amine est lié à l'atome de carbone adjacent au groupe acide carboxylique, ce qui leur confère la structure générique H2N CHR COOH, où R représente la chaîne latérale, qui identifie l'acide ±-aminé.

Les acides ±-aminés jouent un rôle fondamental en biochimie comme constituants élémentaires des protéines : ils polymérisent en formant des liaisons peptidiques qui aboutissent à de longues chaînes macromoléculaires appelées peptides :
H2N CHRa COOH   +   H2N CHRb COOH   ’!   H2O   +   H2N CHRa CO NH CHRb COOH,
où Ra et Rb sont deux chaînes latérales.

Les protéines et les enzymes sont en premier lieu constituées de chaînes polypeptidiques où des dizaines, voire des centaines, d'acides aminés se suivent linéairement dans un ordre précis, appelé séquence peptidique. Chaque protéine possède une séquence peptidique précise qui lui est caractéristique.
Toutes les protéines de tous les êtres vivants connus ne sont constituées — à quelques exceptions près — que de 20 acides aminés différents.
Ces acides aminés, représentés ci-dessous, possèdent chacun un nom qui est en général abrégé en trois lettres (ou une seule). Par exemple, la glycine peut être notée gly (ou g).


Document 4 : Table de déplacements chimiques en RMN


Un chercheur, spécialisé en biochimie, c’est à dire en chimie des molécules présentes dans le vivant, synthétise des protéines par voie chimique. Ceci consiste en l’assemblage d’acides aminés dans un ordre donné afin de reconstituer la séquence peptidique de la protéine.
Il a prévu de synthétiser le fragment suivant :
Gly Ile Leu Val Ala Leu Val

Les acides aminés sont identifiés par leur abréviation en trois lettres (voir le document 3).
Il avait donc préparé cinq flacons contenant chacun un acide aminé différent :
Glycine (gly)
Isoleucine (Ile)
Leucine (Leu)
Valine (Val)
Alanine (Ala)

Malheureusement il a oublié de noter sur chaque flacon l’acide aminé qu’il contient. Il vous charge de replacer les étiquettes.

Question 1

Quelles sont les deux fonctions chimiques présentes dans tous les acides aminés ? Comment se comportent ces deux fonctions d’un point de vue acido-basique ?

Question 2

On donne les pKA associés aux couples acido-basiques dans le cas de la glycine :
pKA1 = 2,3
pKA2 = 9,6


Ecrire les demi-équations correspondant à ces deux couples. Tracer le diagramme de prédominance de la glycine en indiquant le domaine de prédominance de chacune des formes envisageables en fonction du pH.
Le pH du sang est de 7,5. Identifier la forme prédominante de la glycine à ce pH.






Afin de replacer les étiquettes sur les flacons, vous réalisez les spectres RMN des acides aminés contenus dans les cinq flacons.


Question 3 

Il est indiqué dans le protocole pour la réalisation d’un spectre RMN (document 1) qu’il est recommandé d’utiliser un solvant « deuteré ». Un solvant deutéré est un solvant dans lequel les atomes d’hydrogène ont été remplacés par le deutérium, un isotope de l’hydrogène (D= 2H).

Par exemple, le choloroforme deutéré est l’espèce suivante :

Le deutérium ne provoque aucun signal en RMN 1H.

A l’aide de vos connaissances sur la spectroscopie RMN, expliquer ce qu’on observerait si on utilisait un solvant possédant des atomes d’hydrogène 1H, et pourquoi on utilise préférentiellement des solvants deutérés.


Ces spectres sont réalisés en ajoutant un peu d’ « eau lourde » à l’échantillon. On appelle « eau lourde » l’eau deutérée D2O. L’objectif de cet ajout est de permettre le remplacement des protons acides par des atomes de deutérium, c’est à dire les protons des fonctions amine et acide carboxylique. Le deutérium ne provoquant aucun signal en RMN 1H, la conséquence de cet ajout est de faire disparaître les signaux dus aux protons des fonctions amine et acide carboxylique.

Vous obtenez les résultats suivants :

Flacon 1 :
(1) Un doublet de déplacement chimique ´=0,8 ppm, intégrant pour 3H.
(2) Un triplet de déplacement chimique ´=0,9 ppm, intégrant pour 3H.
(3) Un multiplet (non résolu) de déplacement chimique ´=1,2 ppm intégrant pour 2H.
(4) Un multiplet (non résolu) de déplacement chimique ´=1,7 ppm intégrant pour 1H.
(5) Un doublet de déplacement chimique ´=3,4 ppm, intégrant pour 1H.


Flacon 2 :


Flacon 3 :
(1) Un doublet de déplacement chimique ´=0,9 ppm, intégrant pour 6H.
(2) Un multiplet (non résolu) de déplacement chimique ´=1,5 ppm intégrant pour 1H.
(3) Un doublet de doublet de déplacement chimique ´=1,6 ppm intégrant pour 2H.
(4) Un triplet de déplacement chimique ´=3,4 ppm, intégrant pour 1H.

Flacon 4 :



Flacon 5 :




Question 4

A l’aide des informations fournies, représenter, aussi fidèlement que possible, l’allure des spectres RMN des produits contenus dans les flacons 1 et 3.

Question 5

En expliquant votre raisonnement, placer les étiquettes sur les différents flacons.
Fiche 3
Correction à destination des enseignants

TS 10
Spectroscopie RMN

Question 1

Tous les acides aminés possèdent une fonction carboxyle, acide de Brönsted, et une fonction amine, base de Brönsted.

Question 2

-.GHWXfghi™šE 

|
H ³ ´ × ïåË幫›«scUDUsUD6¹hœ5h*/Î6\^JaJ!hœ5h*/ÎB*CJ^JaJphhœ5h*/ÎCJ\^JaJhœ5h*/Î5CJ\^JaJhl4h*/Î5CJ\aJhœ5h*/Î6CJ^JaJhœ5h*¥6^JaJhœ5h*¥56KH^JaJhœ5h*¥6CJ^JaJ"hœ5h*¥56CJKH^JaJ2hœ5h*¥5CJKHOJQJ\^JaJnH tH h*¥OJQJ^Jh’0.hœ55CJOJQJ^J -.5GHXghi÷÷õììçÕÍob
$¤x¤x$Ifa$]kd$$If”uÖ0¡ÿˆ)€vq#öööÖÖÖÖÿ4Ö4Ö
FaöçÿpÖÿÿÿÿytœ5 ¤d$If$¤x¤x$G$Ifa$gdœ5$a$ $*$a$gdœ5$a$gdœ5
i™š±åý E 

|
~
Z G H I ³ ñëëëáááÖëñÍÍÍÍÍÍÍ $$Ifa$ $¤ð$Ifa$ "
& F$If$If
$$G$Ifa$gdœ5³ ´ Ø ’
“
´
‰w`EE
Æ?ø…„„d$G$If^„`„gdì,N
Æ?ø…„„$If^„`„gdœ5$¤x¤x$G$Ifa$gdœ5ukd¯$$If”íÖF¡ÿ—ˆ)€v€ñöööÖ ÿÿÿÖ Ö ÿÖ ÿ4Ö4Ö
FaöçÿpÖÿÿÿÿÿÿytäht× Ø ‘
’
“
´
Á
Ò
Ó
å
û
ü
24JShistžðâ×Ðƹ¯¹£œÆsasVNVsasAhœ5h*¥CJ^JaJh"\^JaJhœ5h*¥^JaJ"hœ5h*¥56CJKH^JaJhœ5h*¥6CJ^JaJhœ5hì,N\]^JaJhbR–h(NË5\]aJ
h(NË5aJhbR–hì,N\]aJhì,N5\]aJhbR–hì,N5\]aJhbR–hì,N]aJ
hì,N]aJh*¥\]^JaJhœ5h*¥\]^JaJhœ5h*¥6CJ\^JaJ´
Á
Ó
å
ü
ææÉ°™;]kdZ$$If”uÖ0¡ÿˆ)v€q#öööÖÖÖÖÿ4Ö4Ö
FaöçÿpÖÿÿÿÿytœ5
Æ?ø…„„$If^„`„gdì,N$
Æ?ø…„d$If`„a$gd(NË$
Æ?ø…„„d$If^„`„a$gdì,N$
Æ?ø…„d$If`„a$gdì,N4hit²ÆÇíáƒí}}}$If]kd $$If”uÖ0¡ÿˆ)€v€q#öööÖÖÖÖÿ4Ö4Ö
FaöçÿpÖÿÿÿÿytœ5 $$Ifa$gd"\$¤x¤x$G$Ifa$gdœ5ž¦«®¯ÆÇÈÑÒøùúHIJ‹Œ•–ÁÂÃáâäåöéÛöéʺ¨ºéö—郗t—öéö—é`—t—éVh*¥OJQJ^J'jNhœ5h*¥CJU^JaJhœ5h*¥0JCJ^JaJ'jYhœ5h*¥CJU^JaJ!jhœ5h*¥CJU^JaJ"hœ5h*¥56CJKH^JaJhœ5h*¥56CJ^JaJ!hœ5h*¥B*CJ^JaJphÿhœ5h*¥CJH*^JaJhœ5h*¥CJ^JaJhœ5CJ^JaJÇÈÒùã¡‰}‰ $$Ifa$gdœ5$If$¤x¤x$G$Ifa$gdœ5]kd¸$$If”uÖ0¡ÿˆ)€v€q#öööÖÿÿÖÖÖÿ4Ö4Ö
FaöçÿpÖÿÿÿÿytœ5ãäåî()~€¼½¡Ÿ—ŸŸŽŽ‰‰‰‰‰‰$a$ $*$a$gdœ5$*$gdœ5]kdý$$If”ýÖ0¡ÿˆ)€vq#öööÖÿÿÖÖÖÿ4Ö4Ö
FaöçÿpÖÿÿÿÿytœ5
åìíî
()€½ìíõöùú›×çÒ纥š€vi[M=M=M=Mi[hœ5h*¥6CJH*^JaJhœ5h*¥6CJ^JaJhœ5h*¥5CJ^JaJhœ5h*¥CJ^JaJh*¥OJQJ^J2hœ5h*¥5CJKHOJQJ\^JaJnH tH hWYZ5OJQJ^J)h*¥5CJKHOJQJ^JaJnH tH /hœ5hœ55CJKHOJQJ^JaJnH tH )hœ55CJKHOJQJ^JaJnH tH /hœ5h*¥5CJKHOJQJ^JaJnH tH ½Af†›œ×ÙÛÜÝÞßàáâãäåæç#$ÐÐÐÐËËËÆÆËËËËËËËËËËËËËËgd‡!$a$/$$d%d&d'd-DMÆ
ÿòòòNÆOÆPÆQÆa$×ØÙÚÛè*,-jklœŸ ¡¢£ÜÝÞ
 
ðåÔƼ¯¡¯|m¡bT¡¯@m¡'jqhœ5h*¥CJU^JaJhœ5h‡!6CJ^JaJh‡!6CJ^JaJhœ5h*¥0JCJ^JaJ'jžhœ5h*¥CJU^JaJ!jhœ5h*¥CJU^JaJhœ5h*¥6CJ^JaJhœ5h*¥CJ^JaJh‡!CJ^JaJhœ5h*¥5CJ^JaJ!jhœ5h‡!CJU^JaJh‡!5CJ^JaJjh‡!UmHnHtH u$*
KLþØïêêâà±±€1$¤x$d%d&d'd-DMÆ
ÿòòòNÆOÆPÆQÆa$/$$d%d&d'd-DMÆ
ÿòòòNÆOÆPÆQÆa$$a$gdWYZ$a$$„L„ˆ^„L`„ˆa$gd‡!
7KLP]õör|Þ^`hj~€ž¼ÂÒØÚÜäóéÛóÛȴȠȌȌȠȌȌȌȌÈu]u/hœ5h*¥6B*CJH*^JaJmH phsH ,hœ5h*¥6B*CJ^JaJmH phsH 'hœ5h*¥6B*CJ]^JaJph'hœ5h*¥6B*CJH*^JaJph'hœ5h*¥6B*CJ\^JaJph$hœ5h*¥6B*CJ^JaJphhœ5h*¥5CJ^JaJhWYZCJ^JaJhœ5h*¥CJ^JaJäæèêò (*,.>@HJLNX^`bpvxçϸž¸žƒž¸çϸžƒž¸Ï¸çϸž¸çϸp\'hœ5h*¥6B*CJ]^JaJph$hœ5h*¥6B*CJ^JaJph5hœ5h*¥56B*CJH*\^JaJmH phsH 2hœ5h*¥56B*CJ\^JaJmH phsH ,hœ5h*¥6B*CJ^JaJmH phsH /hœ5h*¥6B*CJH*^JaJmH phsH /hœ5h*¥6B*CJ]^JaJmH phsH ØpÂĐÐÒÔ͞žmmmc^^$a$ $¤xa$gd‡!1$¤x$d%d&d'd-DMÆ
ÿòòòNÆOÆPÆQÆa$/$$d%d&d'd-DMÆ
ÿòòòNÆOÆPÆQÆa$2$$d%d&d'd-DMÆ
ÿòòòNÆOÆPÆQÆa$gd‡! xz‚„†ÐÑÒÓ a c ä å ð ñ !›!œ!ëØÄëس¥š¥‰|l|_M?|M?hœ5hWYZ5CJ^JaJ#h²]h*¥5CJOJQJ^JaJhœ5hWYZCJ^JaJhœ5h*¥5CJ\^JaJhœ5h*¥CJ^JaJ!jVhœ5h*¥CJU^JaJhWYZ5CJ^JaJhœ5h*¥5CJ^JaJ!j
 :